L'eau fait partie du bien commun de la Nation. Sa protection, sa préservation, sa mise en valeur, le développement des territoires et des activités, doivent se faire dans le respect des équilibres naturels, et sont d'intérêt général (inscrit au Code de l'Environnement)

Certaines activités ou usages de l'eau par l'Homme nécessitent des prélèvement d'eau dans le milieu ou les nappes phréatiques, produisent des rejets, des pollutions, des perturbations du cycle naturel des eaux.

Cet usage est considéré comme prioritaire sur le bassin.

En 1988, le recensement général agricole dénombrait presque 6800 exploitations agricoles sur le bassin.

Une vingtaine d'industries répertoriées à la DREAL et ICPE sont présentes sur le bassin. Cet usage représente une part relativement faible en termes de prélèvement d’eau sur le bassin.

Le parcours de la Boutonne, à l'amont de Saint-Jean-d'Angély alimentait au XIXème siècle près de 180 moulins à grains, à huile, à poudre et à draps.

Le classement en catégories piscicoles des cours d’eau du bassin distingue leur vocation piscicole : salmonicole (1ère catégorie) et cyprino-ésocicole (2è catégorie).

Des chemins de randonnée sont aménagés le long des cours d’eau pour permettre la pratique de ce loisir. Le Conseil Départemental de Charente-Maritime et les inter-communalités travaillent à la coordination de ces différents sentiers pédestres dans le but de créer des itinéraires et promouvoir notammentle territoire des bords de Boutonne.

Le cours de la Boutonne offre de nombreux parcours navigables et très agréables